Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cwc27Q3TKY6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cwc27Q3TKY6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms