Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc13Q3TIR1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc13Q3TIR1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms