Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Eepd1Q3TGW2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eepd1Q3TGW2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms