Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEI4

Uncharacterized protein C15orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TEI4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3TEI4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TEI4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TEI4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TEI4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TEI4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TEI4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TEI4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TEI4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TEI4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q3TEI4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TEI4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TEI4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TEI4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TEI4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TEI4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q3TEI4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TEI4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TEI4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TEI4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TEI4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TEI4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q3TEI4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms