Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem104Q3TB48 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem104Q3TB48 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms