Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prr27Q3SYJ2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms