Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Riiad1Q3KNY5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Riiad1Q3KNY5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Riiad1Q3KNY5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms