Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG1

Rhox4c, MCG125587, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4cQ2MDG1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhox4cQ2MDG1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4cQ2MDG1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms