Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Shroom4Q1W617 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Shroom4Q1W617 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms