Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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