Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf3ip1Q149C2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Traf3ip1Q149C2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Traf3ip1Q149C2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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