Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VgfQ0VGU4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms