Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b3Q0VF55 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b3Q0VF55 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms