Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb8Q0VBD0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms