Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Vps8Q0P5W1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Vps8Q0P5W1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vps8Q0P5W1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms