Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc21bQ0HA38 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms