Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Znf541Q0GGX2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf541Q0GGX2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms