Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcnt1Q09324 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcnt1Q09324 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms