Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pate4Q09098 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pate4Q09098 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms