Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ssrp1Q08943 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssrp1Q08943 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms