Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tgm3Q08189 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm3Q08189 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms