Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col9a2Q07643 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms