Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Col17a1Q07563 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Col17a1Q07563 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Col17a1Q07563 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Col17a1Q07563 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms