Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cntn3Q07409 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cntn3Q07409 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms