Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp2Q06649 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp2Q06649 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms