Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atf4Q06507 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms