Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms