Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPINDOCQ05AH6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms