Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Caprin2Q05A80 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Caprin2Q05A80 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms