Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprgQ05909 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprgQ05909 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprgQ05909 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms