Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sox9Q04887 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms