Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcnd1Q03719 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcnd1Q03719 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnd1Q03719 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnd1Q03719 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcnd1Q03719 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms