Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna1sQ02789 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacna1sQ02789 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms