Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb4Q02738 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb4Q02738 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb4Q02738 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb4Q02738 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb4Q02738 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjb4Q02738 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms