Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Muc1Q02496 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Muc1Q02496 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms