Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VcpQ01853 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VcpQ01853 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VcpQ01853 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VcpQ01853 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VcpQ01853 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VcpQ01853 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VcpQ01853 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VcpQ01853 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VcpQ01853 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VcpQ01853 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VcpQ01853 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms