Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cacna1cQ01815 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms