Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme2Q01768 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme2Q01768 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms