Protein–RNA interactions for Protein: Q01755

Tcp11, T-complex protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp11Q01755 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcp11Q01755 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcp11Q01755 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcp11Q01755 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcp11Q01755 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcp11Q01755 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcp11Q01755 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcp11Q01755 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcp11Q01755 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcp11Q01755 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcp11Q01755 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tcp11Q01755 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tcp11Q01755 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp11Q01755 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms