Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23aQ01405 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23aQ01405 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms