Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VegfaQ00731 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfaQ00731 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms