Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp4Q00724 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp4Q00724 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms