Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F8a1Q00558 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms