Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms