Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabpb1Q00420 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms