Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pax8Q00288 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms