Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Stx2Q00262 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Stx2Q00262 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms