Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms