Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VldlrP98156 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VldlrP98156 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VldlrP98156 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms