Protein–RNA interactions for Protein: P97440

Slbp, Histone RNA hairpin-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlbpP97440 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SlbpP97440 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlbpP97440 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms